Projekty a granty
Databáze všech projektů a grantů od roku 2010
| Eukaryotní diverzita a adaptace: integrovaný multi-omický přístup k molekulárním mechanismům | |
|---|---|
| Id projektu | SGS06/PŘF/2026 |
| Hlavní řešitel | Mgr. Karolína Skýpalová |
| Období | 1/2026 - 12/2026 |
| Poskytovatel | Specifický VŠ výzkum |
| Stav | řešený |
| Anotace | Projekt je zaměřen na komplexní studium evolučních procesů, genomové organizace a virových interakcí napříč hlavními liniemi eukaryot, přičemž integruje metodiky moderní bioinformatiky, genomiky, transkriptomiky a proteomiky. Cílem je vytvořit ucelený rámec pro analýzu molekulárních mechanismů, které formují diverzitu eukaryot a určují jejich funkční vlastnosti. Výzkum zahrnuje několik komplementárních oblastí: anotaci a fylogenetickou charakterizaci genů nadrodiny Ras a dalších proteinů asociovaných s cilární aparaturou u hluboce divergujících taxonů (1); detailní studium evoluce mitochondriálního genetického kódu u opistokontů se zaměřením na molekulární příčiny a funkční důsledky změn kodonového významu (2); vývoj automatizovaného výpočetního pipeline pro detekci vybraných eukaryotních dsDNA virů, jejich fylogenomickou analýzu a systematickou anotaci virových genomů (3); analýzu diverzity intronů a adaptací spliceozomu v rámci kmene Euglenozoa (4); multi-omické studium biologie Trypanosomatidae zahrnující mechanismy udržování Leishmania RNA viru i mapování subcelulární distribuce proteinů metodou LOPIT (5); a komparativní analýzu transkriptomů cirkulujících nádorových buněk a plazmatických buněk kostní dřeně u pacientů s mnohočetným myelomem s cílem identifikovat molekulární faktory odpovědné za egrese nádorových buněk z kostní dřeně (6). Přestože je projekt primárně orientován na základní výzkum, generovaná data a metodická řešení mohou představovat významný podklad pro budoucí aplikace v oblasti virové diagnostiky, klinické genetiky či biomedicíny. Očekávané výsledky budou publikovány v mezinárodních impaktovaných časopisech a prezentovány na odborných konferencích. Vzhledem k zapojení studenta ze zahraničí jsou jednotlivé tematické části projektu interně zpracovávány a prezentovány převážně v anglickém jazyce. |
| Celkové náklady | 829 000 CZK |
